Como no Município, instalado no dia 02 de março de 1864 e reinstalado a 06 de agosto de 1935, foi criado com a freguesia de Nossa Senhora do Rio do Peixe (Natividade). O Decreto Lei 14.334, de 30 de novembro de 1944, modificou-lhe o nome para Natividade da Serra.
Foi incorporado o distrito de Bairro Alto, pela Lei n.º 15, de 18 de abril de 1863.
Em 1973, com a construção da barragem de Paraibuna, ocorreu a inundação da cidade antiga, surgindo a nova Natividade da Serra.
A pesca e a represa atraem hoje turistas da região e da capital.

Sistema Geográfico

O Município está situado na zona fisiográfica do Alto Paraíba, à margem esquerda do Rio do Peixe, em uma planície cercada de montanhas, apresentando a sede municipal as seguintes coordenadas geográficas: 23º23'16" de latitude sul e 45º27'14" de longitude W.Gr., distando 122 km, em linha reta, da capital do Estado.

Altitude (sede municipal): 750 metros.

�rea: 846km² (terceiro município em extensão territorial do Estado de São Paulo).

Clima: Temperado com inverno seco. A temperatura média oscila entre 17º e 18º C, tendo uma intensidade de chuvas da ordem de 1300 a 1500mm.

Confrontantes: localizado na Região Alto-Paraíba, confronta com a Serra do Mar, entre os rios Paraitinga/ Paraibuna, sendo a sede banhada pelo reservatório implantado pela CESP, na confluência desses rios.
Limita-se com os municípios de Redenção da Serra, São Luiz do Paraitinga, Ubatuba, Caraguatatuba e Paraibuna.

Particularidades geográficas: os acidentes geográficos mais importantes são a Serra do Mar, Cordilheiras do Itambé e Serra Azul; tem como principais rios o Paraibuna, Paraitinga, Lourenço Velho, Peixe, Pararaca e Manso.

Sistema Demográfico

O Município conta com 6.269 habitantes.